Milyen férgek vannak az emberi kromoszómában. Humán genom
Fodor András Olvasóim számára talán nem újság, hogy meghatározták az ember genetikai anyagában, DNS-ében az azt felépítő építőelemek nukleotidok 97 százalékának sorrendjét szaknyelven: szekvenciáját.
E cikkemben egy évvel ezelőtti írásom A biológusok Apollo-programja folytatására vállalkozom. Akkor elmondtam, hogy az ember genetikai anyagát alkotó építőelemek sorrendjének meghatározása — az úgynevezett HUGO humán genom művészeti élet parazita tisztítás — az emberiség legnagyobb vállalkozása a biológia területén, amely jelentőségében és költségeiben egy bolygó meghódításának programjához hasonlítható.
Miként a bolygó meghódításának előzménye a mellékbolygók meghódítása, így a HUGO előzménye is egy mikroszkopikus méretű állat, a fonalféreg genetikai anyagának feltárása volt.
Fonalférgekből több százezer faj van, mindegyiknek más a neve.
Ártalmatlantól a halálos garázdaságig
A tudomány történelemkönyvébe magát beíró faj tudományos neve: Caenorhabditis elegans, röviden: C. Ez a munka decemberére fejeződött be. Pedig megtörtént: a HUGO-program sikeresen befejeződött. Géntérkép, genetikai térkép vagy az élet könyve? Mindjárt az elején tegyünk helyére egy félrevezető fogalmat: nem géntérkép az, ami elkészült. A genetikaitérkép-készítés során öröklődő tulajdonságokért felelős gének egymástól való relatív távolságát határozzuk meg klasszikus genetikai kísérletekkel a kromoszómán.
Account Options
A genetikai térképezésnek nem feltétele, hogy az illető gént biokémiailag ismerjük. Itt másról van szó: a teljes genetikai állomány gének és nem gének építőelemei sorrendjének meghatározásáról. Az új eredmény költői túlzás nélkül nevezhető az élet könyvének. Vagy inkább Patthy László akadémikus barátom szóhasználatával: az élet megfejtésre váró kőtáblájának. Amelynek szövegében most a betűk sorrendjét állapították meg.
- Humán genom – Wikipédia
- Fergesseg kezelese hazilag
- A Humán Genom Program
A genom sorrendbe rakott építőkövei, nukleotidbetűi önmagukban nem alkotnak értelmes szöveget. Inkább pontosan reprodukált betűhalmazhoz hasonlíthatóak.
Jeles képviselők
A kőtábla olvasása a HUGO-program, megfejtése a funkcionális genomika feladata. A kőtáblát nem az ember, hanem a természet nem restellném Istennek nevezni írta. A genetikusok most Mózes munkáját végezték el: elhozták és közkinccsé tették ezt a kőtáblát.
Bárki olvashatja. Már aki tud olvasni. A megfejtés feladata azonban előttünk áll. A tudományterület, ami ezzel foglalkozik, a századvég újszülöttje, s feltehetőleg a jövő század óriása. A molekuláris genetika és az informatika házasságából született.
Tartalomjegyzék
Neve: funkcionális geno-mika. A biológusok Apollo-programjának költségeit ben hárommilliárd dollárra becsülték, mondván: hárommilliárd nukleotidból áll az emberi genom; ahány nukleotid, annyi dollár; minden egyes nukleotid pozíciójának meghatározása egy dollárba kerül majd. Ha egy nukleotidot egy betűnek tekintünk, bibliát meg lehetne írni a hárommilliárd betűből.
Kezdetben azt hittük: ez az összeg kevés lesz.
Ám végül a tervezett költségek fele megmaradt; egy nukleotid pozíciójának meghatározása előbb 18 dollárcentre, majd egy centre csökkent.
Minek köszönhető ez? Alighanem a versenyhelyzetnek. Azután ban az amerikai magánszférából versenytárs érkezett: a Celera Genomics. Ez újabb versenyt indukált.
Navigációs menü
Az összetört DNS-darabok építő-kősorrendjét meghatározó, majd a DNS-darabokat sorrendbe rakó és illesztő robotokat gyártó cégek a PE Biosystems és az Amersham Pharmacia Biotech vállalatok keltek versenyre, hogy olyan csodakomputereket készítsenek, melyek sci-fi regénybe illő sebességgel tudnak dolgozni.
Két munkacsoport: kétféle stratégia. A mérkőzés mégis döntetlenre végződött.
- Ivott tablettákat a férgektől, és jobb lett
- Egy mikroba például plazmidokban teszi ezt, azaz egy ilyen mikroba meg szekvenálásaa plazmidok szekvenciáinak megismerését is jelenti egyben.
- Kábítószer típusú férgek
- Giardia gastroenteritis
- Létrehozva:
- Kórokozó fertőzés
- Az apák epigenetikai információi is átkerülnek az utódokba - Arsratio
A John Sulston milyen férgek vannak az emberi kromoszómában vezette munkacsoport a Cambridge környéki Sanger Centerben olyan tudományos stratégiával dolgozik, komplex méregtelenítés a genetikai anyagot egymást átfedő darabokra tördelik, és az egymáshoz illeszthető darabokat, mint a dominót, kirakják, egészen addig, míg további hozzáilleszthető darab már nincs.
Így létrejön egy alakzat. Az emberi DNS-ből 23 ilyen alakzat rakható ki. Mindegyikben egy DNS-molekula. Az átfedő darabokat kromoszómákhoz rendelték.
Végül a 23 DNS-molekula-építőkő nukleotid sorrendjét határozták meg. Tekintsünk el annak részletezésétől, hogy hogyan csinálták. Minden egyes DNS-darabot megsokszoroztak, klónoztak: baktérium- vagy élesztősejtekben felszaporították, majd visszanyerték őket.
Az apák epigenetikai információi is átkerülnek az utódokba
Kihasználták a DNS-nek azt a tulajdonságát, hogy a kettős spirál szétválasztott szálain lévő testvérszakaszok egymást felismerik DNS-hibridizációa különbözőképpen összetört DNS-darabokat dominószerűen sorba rakhatjuk. Az ember genetikai állománya 23 DNS-molekulából áll, ezek 23 milyen férgek vannak az emberi kromoszómában szerveződnek.
A dominókirakós módszerrel mind a 23 emberi kromoszómát ki lehetett rakni DNS-darabkákból. Ezt hívjuk fizikai kromoszóma-térképezésnek. Ezzel szemben a Celera iparosai fütyültek a kromoszómákra.
Humán genom
A lehető legdrasztikusabban ripityára törték a DNS-t, és teljesen a komputerre bízták az átfedő darabkák egymáshoz illesztését. De a tudomány iránytűje elég volt ahhoz, hogy ne tévedjenek el a járatlan úton — ahogy a ma élő legnagyobb genetikus, Rédei György megfogalmazta.
Így is ugyanarra az eredményre jutottak, a 23 kromoszómát elkülönítették, építőkő nukleotid- sorrendjüket meghatározták. Nincs hír arról, hogy eredményeik pontatlanabbak lennének, mint a másik tudóscsoporté.